LoliTrack 动物行为学分析软件-上海玉研科学仪器有限公司

详细介绍

LoliTrack5是一款超级快速直观的Windows软件用于2D和3D视频跟踪和动物行为分析。简单地从你的相机加载一个视频文件到软件并开始跟踪。跟踪是基于对比或背景减法(不需要标记)并且具有丰富的工具模块可用于深入分析动物行为。

的是LoliTrack5可以在处理遮挡(即交叉轨迹)时识别和跟踪自由放散的群体如鱼群、虫群或群体中未标记动物等。

LoliTrack5 的应用

·微孔板分析(如对斑马鱼分析)

·行为表型(病灶动物)

·啮齿动物试验(例如在迷宫或露天野外试验)

·群体行为(如昆虫、浮鱼和微生物)

·移动行为(例如在笼子水族馆和野外)

·社会和性行为(如IID和动物取向)

使用方式

LoliTrack5适用于大多数相机和视频文件格式。只需用相机录制一个视频文件并将视频加载到软件中开始跟踪。该软件也具有视频录制和编辑工具使用方便一站式解决。

使用标配或自备的视频采集设备采集到动物的运动图像导入到LoliTrack5中进行识别和分析即可输出分析数据可分析参数包括如位置、速度、加速度、方向、旋转等。

产品特点

1.同时追踪1-24只动物（一个单位容器）

2.支持多个单位容器同时追踪如24、48、96孔板等

3.兼容大多是相机和视频格式

4.具有丰富的分析工具集可分析20+个数据参数

5.确定具体的身体点进行运动和运动学研究

6.生成并导出数据参数和分布热图

7.具有可定制图形的深度分析工具

8.可用频率分析估计心率和鳃频率

9.真正的三维跟踪导出坐标和三维路径

10.批量分析多个视频节省时间

分析参数

1.加速度

2.移动距离

3.速度和速度

4.激活/非激活时间和%

5.到区域中心的距离

6.在区域中花费的时间和百分比

7.运动方向和方向

8.转动速度:移动或方向的转动速度

9.动物到区域中心的距离

10.个体间距离(IID)

11.平均个体间距离(AIID)

12.个体间距离中位数(MIID)

13.最近邻距离(NND)

14.弯曲(即身体摆动的角度如尾拍频率等)

15.前、后、中线中心和重心的原始和校准的X/Y位置

软件功能示例

可以选择单个的动物进行跟踪和分析而不是必须跟踪所有的动物。自定义名称和标签颜色便于识别。还可以在视频时间轴上选择用户自定义的时间间隔以排除特定的视频片段进行跟踪。

如果您想要分析特定感兴趣区域内的动物行为可以直接在视频预览中绘制任意数量的区域。对每个区域的行为进行评分并自动导出每个区域的统计数据。

识别特定的身体点(尾巴、头部、中线中心、重心)并可以单独跟踪每个点用于研究运动学(尾部拍频、身体振荡等)或特定行为(方向或运动方向、转弯速率等)。其他有用的工具包括根据位置、速度、加速度、活动和转弯速率生成动物的中线和热图。

您可以将所有数据参数导出为.xlsx文件到Excel只需单击一次。导出每个参数或选择你需要的参数。在导出的文件中您

可以获得单个动物、动物组以及每个用户定义的测试单元和区域的分析数据和原始数据。在LoliTrack5中一些参数也可以作为可定制或作为图形导出。

通过两个摄像头或文件(立体技术)LoliTrack5提供了在空气或水中的焦点动物的真实3D视频跟踪考虑到空气到水的光传输因素。坐标以及轨迹的数字3D模型可以以不同的格式导出以便在其他软件包中进一步可视化或分析。

相关文献

1) Alcaraz A J G, Baraniuk S, Mikulášek K, et al. Comparative analysis of transcriptomic points-of-departure (tPODs) and apical responses in embryo-larval fathead minnows exposed to fluoxetine[J]. Environmental Pollution, 2022, 295118667.
2) Di Cicco M, Di Lorenzo T, Fiasca B, et al. Effects of diclofenac on the swimming behavior and antioxidant enzyme activities of the freshwater interstitial crustacean Bryocamptus pygmaeus (Crustacea, Harpacticoida)[J]. Science of the Total Environment, 2021, 799:149461.
3) Wang X, Cheng E, Burnett I S, et al. Automatic multiple zebrafish larvae tracking in unconstrained microscopic video conditions[J]. Scientific reports, 2017, 7(1)17596.
4) Henry J, Rodriguez A, Wlodkowic D. Impact of digital video analytics on accuracy of chemobehavioural phenotyping in aquatic toxicology[J]. PeerJ, 2019, 7e7367.
5) 刘慧杰, 王从锋, 刘德富, 等. 不同运动状态下鳙幼鱼的游泳特性研究[J]. 南方水产科学,2017, 13(2)85-92.
6) Cruz-Rosa S, Pérez-Reyes O. Titanium Oxide Nanoparticles as Emerging Aquatic PollutantsAn Evaluation of the Nanotoxicity in the Freshwater Shrimp Larvae Atya lanipes[J]. Ecologies, 2023, 4(1)141-151.
7) Rountos K J, Gobler C J, Pikitch E K. Ontogenetic differences in swimming behavior of fish exposed to the harmful dinoflagellate Cochlodinium polykrikoides[J]. Transactions of the American Fisheries Society, 2017, 146(5)1081-1091.
8) Nay T J, Johansen J L, Habary A, et al. Behavioural thermoregulation in a temperature-sensitive coral reef fish, the five-lined cardinalfish (Cheilodipterus quinquelineatus)[J]. Coral Reefs, 2015, 341261-1265.