详细介绍
PsychoFish 可用于成年斑马鱼(3 月龄)或幼年斑马鱼(1-2 月龄)群体凝聚力及个体运动能力及趋势两方面的研究。
系统组成
其包含以下3 个组成部分
1. 机械单元
2. 图像采集系统
3. 数据显示、存储、分析硬件/软件
PsychoFish 系统有如下特点
1. 设计精巧方便安装和拆卸;
2. 126*50*125cm 铝制框架构成机械单元基座稳定性高;
3. 最多4 个10*20*5cm 大小斑马鱼池可被同时放置于基座进行实验;
4. 基座表面为乳白色玻璃材质保证其上方鱼池均匀的光线分布;
5. 提供两种不同的照明方式下方白色背景灯照明和上方下拉式照明满足不同实验需求;
6. 图像采集器包含前后双摄像头置于机械单元铝制水平杆上提供的图像采集;
7. KOMI 图像分析程序可从群体凝聚力和运动强度两方面分析采集到的图像高效便利。
数据处理及分析
(1)斑马鱼群体凝聚力分析
观测群里凝聚力时需要考虑多方面的因素包括空间需求、水深、个体数目或群体规模等PsychoFish 建议在深度为2cm 的水中进行测试。测试时位于机械单元水平杆上的前后摄像头可记录每一斑马鱼个体的运动情况拍摄成一系列的图片然后通过KOMI 程序进行分析即可。图片拍摄、鱼池尺寸和数目等参数可通过软件面板进行设置。
视频采集过程中软件使用图解和数值计算的方式自动对采集的图像进行分析得到各种评价斑马鱼群行为学的数据。软件识别图像中的斑马鱼个体并用白色十字标记所有呈现于屏幕的斑马鱼个体可形成一区域多边形多边形面积、斑马鱼个体间距等数据即可用于反映鱼群群体凝聚力大小。
软件分析过程中以下计算数据可输出至Excel 表格中
多边形的面积
最长对角线长度
重心的坐标(相对于实验区域中点位置)
重心距离参照点的距离
个体间的距离包括最近距离、最远距离、平均距离
鱼对之间的平均距离
(2)个体运动能力及趋势分析
个体运动能力测试建议水深2cm最多四个鱼池同时测试。测试期间机械
单元上的摄像头可记录每个斑马鱼个体的运动情况并保存一系列图片通过对
图片的识别和分析得到其运动能力和趋势数据。图片拍摄、鱼池尺寸和数目等参
数可通过软件面板进行设置。
视频采集过程中软件使用图解和数值计算的方式自动对采集的图像进行分析得到各种评价斑马鱼群行为学的数据。软件识别图像中的斑马鱼个体并用彩色十字标记被标记的斑马鱼个体以及其运动轨迹会呈现于分析窗口。同时所有斑马鱼运动速度及路程也会被计算并输出至Excel 表格中。
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