液相色谱仪分析样品的种类繁多，物理形态广泛，组成及其浓度复杂多变，对分析结果的干扰因素很多，为达到分析目的，样品要进行有效的预处理。
样品预处理的重要性
1、样品预处理所用时间远大于色谱分离时间；
2、消耗大量的溶剂和其它化学品，占分析消耗总成本；
3、样品预处理是实验的重复性和准确性最差的环节，是影响实验结果好坏的最重要因素。
样品预处理的目的
1、除去微粒，减少干扰杂质；
2、浓缩微量组分；
3、提高检测的选择性和灵敏度；
4、改善分离效果；
5、有利于色谱柱和仪器的保护；
6、使样品形式和所用溶剂符合HPLC的要求。
样品预处理达到的要求
1、样品全部转化为低浓度溶液；
2、样品溶液洗脱强度低于流动相，与流动相相溶。
样品预处理的原则
1、在样品预处理过程中，尽可能防止和避免与待测组分发生化学反应； 
2、在样品预处理过程中，如果与待测组分进行化学反应，那么这一反应必须是已知的，而且可以定量的完成；
3、在样品预处理过程中，要防止和避免待测组分被玷污，尽可能减少无关化合物引入制备过程；
4、样品的处理过程应尽可能简单易行，所采用的样品处理装置尺寸应与样品处理量相适应；
5、采样之后应尽可能快的进行样品的分析测定，或使用合适的方法消除可能的变化和干扰。
样品预处理方法
1、过滤、离心：
常用的滤膜材质有纤维素、聚四氟乙烯和聚酰胺。其中聚酰胺应用zui广。
2、加速溶剂萃取：
加速溶剂萃取是在提高温度（50～200℃）和压力（10.3～20.6MPa）下，用溶剂萃取固体或半固体样品。
3、超临界流体萃取：
超临界流体萃取是利用超临界流体对物质的特殊溶解性能原理而建立的萃取方法。
4、固相萃取：
固相萃取是通过采用选择性吸附和选择性洗脱对样品进行富集、分离和净化，可以将其近似地看作一种简单的液固色谱过程。
5、固相微萃取：
固相微萃取是基于涂敷在纤维上的高分子涂层或吸附剂和样品之间的吸附－解吸平衡原理，集采样、萃取、浓缩和进样于一体的无溶剂的样品微萃取方法。有直接固相微萃取、顶空固相微萃取、膜固相微萃取和毛细管固相微萃取等。
6、液相微萃取：
液相微萃取是基于样品和微升级甚至纳升级有机溶剂之间的分配平衡原理，集采样、萃取和浓缩于一体的环境友好的样品微萃取方法。
有直接液相微萃取、中空纤维液相微萃取和顶空液相微萃取等。
7、衍生化：
有紫外衍生化、荧光衍生化和电化学衍生化等。