如果流动相均由液相色谱仪级溶剂组成，流动相没有必要过滤。这是因为高效液相色谱级的有机溶剂，例如乙腈、甲醇等，在制造的工艺过程中都已经过了0.2μm微孔滤膜过滤。同样，无论你是买的HPLC级的水还是在实验室使用超纯水净化系统制备的水，步也是通过0.2μm微孔滤膜，然而，如果有任何一种缓冲液中加入了固体物，例如，磷酸盐，流动相过滤将是必要的一个步骤。

液相色谱仪虽然缓冲盐可能是可溶解的、高纯的，但它还是可能含有颗粒物质，例如在盖试剂瓶的塑料内盖时，塑料瓶盖子与瓶口边缘挤压就会产生塑料颗粒。在这种情况下，添加的一种固体物可能溶解了，但是少量杂质颗粒存在于流动相中成为残渣。流动相通过0.45μm微孔滤膜过滤对于从流动相中除去所有颗粒物是一个有效方法。0.2μm微孔滤膜也可以用，但是它们就这个应用而言并不比0.45μm微孔滤膜更有效，而且它的过滤速度会更慢，特别是当实验室使用的试剂和水的质量不太好时。

建议实验室在编写液相色谱仪制定他们流动相制备标准操作程序（SOPs）时规定，可以借鉴国际上同类实验室的规定，即：流动相制备仅采用HPLC级液体时不需要过滤，反之所有流动相组成在使用前必须过滤。在连接储液瓶和泵的输液管的末端入口采用下沉式过滤器（常见材质有熔融玻璃砂芯滤板和微孔金属的两种）也是很重要的。这个过滤器的规格为≥10μm的微孔物质，所以，它不能取代流动相过滤步骤，但是它能除去系统中的尘土并保证储液瓶、输液管使用的可靠性。