痕量分析主要应用于地球化学、材料科学、生物医学、环境科学、表面科学以及罪证分析等领域，痕量分析是样品中待测组分含量低于百万分之一的分析方法，对于检测方法的要求高。

痕量分析常用的分离，富集方法有挥发，沉淀和共沉淀，电解，液-液萃取，离子交换，色谱，萃取色谱，电泳等，在分离、富集过程中对于污染和痕量组分的损失要予以充分注意。液相色谱仪应用于复杂基质中痕量成分的定量分析，复杂微量组分的分离、纯化、制备，多用于环境、食品安全、药代动力学等方面。

液相色谱柱具有高柱效并且流动相可以控制和改善分离过程的选择性因此高效液相色谱仪不仅可以分析不同类型的有机化合物及其同分异构体还可以分析在性质上极为相似的旋光异构体并已在高疗效的合成药物和升华药物的生产控制分析中发挥了重要作用。