实验室现在真空泵的使用越来越广泛了，大多数实验室设备都会配上真空泵，因为真空泵不是一个单一的设备，它可以和其他的仪器配套使用。如真空抽滤器、废液抽取仪、旋转蒸发仪、真空干燥箱、冻干机等设备。
一般在实验室中使用的真空泵用途有两大类：真空抽滤及真空干燥。
真空抽滤一般搭配各种实验室真空过滤装置，如溶剂过滤器、砂芯过滤瓶、布氏漏斗过滤瓶、瓶顶式过滤器、微生物限度检测过滤装置、多联过滤器等等。简单地说就是利用真空泵、微型真空泵等能提供真空的设备，使固体、液体混合物等分离速度加快的一种应用。真空抽滤常常被医疗、科研等进行试验时用到，所以一般情况下，体积庞大、噪音高、功耗高的大型真空泵并不合适，常用的是微型真空泵、小型真空泵。
真空干燥是利用低压状态下液体沸点降低，在常温下即能沸腾蒸发，从而使样品去水或溶剂等物质，从而达到样品浓度升高或结晶的方法。
在实验室中用的较多、较看重的就是无油活塞式（多用于微生物检测）和耐腐蚀隔膜式（多用于化学实验室）两种，活塞式一般和真空抽滤、微生物检测、废液抽取、真空干燥箱等设备配套使用。耐腐蚀隔膜式一般和旋转蒸发仪、真空干燥箱、离心浓缩等配套使用。
非干式真空泵，例如油式真空泵、水循环真空泵。非干式真空泵共同点是它需要借助其他的物质（如水和油）达到理想的真空度，在实验室中使用最多的就是油旋片泵，一般和冻干机、真空干燥箱等配套使用。
选购时首先要了解真空泵用于实验室的作用，比如真空抽滤、真空干燥。以及真空泵抽的气体可否有腐蚀性，比如试剂纯化、样品过滤。一般过滤样品，可选择无油式真空泵，如果是试剂纯化，要选择耐腐蚀真空泵。
其次从真空泵配置在其他仪器设备的考虑。如果用于配置旋转蒸发仪就得使用耐腐蚀真空管，旋蒸挥发的气体都带有一定的腐蚀性；如果是用于干燥箱，可以选择真空比较高的真空泵，比如旋片油封泵。
