紫外线杀菌器采用灭菌荧光灯，发生波长约为254纳米(2537埃)的光。带有细菌/藻类的水经过灯泡(或者假如使用石英套管，则在灯泡周围)，并遭到该波长的辐射。当光线穿透细菌/藻类时，它会使脱氧核糖核酸(遗传物质)发生变异，阻止生物体的成长。

　　哪些因素影响紫外线灭菌器的作用？

　　1、生物体的巨细和类型:理论上，紫外线辐射能够杀死病毒、细菌、藻类和原生动物。一般来说，较大的生物体，如原生动物，比较小的生物体，如细菌，需求更高剂量的紫外线辐射。但是同一类型的不同生物之间也有差异:一些细菌比其他细菌更能反抗紫外线辐射。

　　2、灯泡功率:灯泡发生的紫外光量反映在灯泡的瓦数上。瓦数越高的灯泡发生的紫外线越多。灭菌荧光灯发生紫外线的才能随着年龄的增长而下降，在大多数情况下，灯泡需求每6个月替换一次。紫外线建议在104-110华氏度的温度下发生；较低的温度会导致产值削减。

　　3、紫外线渗透:假如紫外线不能穿透水，它就不会有用。较高的水浊度会下降渗透率。紫外线杀菌器应放置在生物和机械过滤器之后，这样水进入消毒器时就尽可能洁净。盐度也影响渗透；紫外光比盐水更能穿透淡水。然后灯或套管的清洁度很重要。假如薄膜或矿藏沉积物覆盖灯或套管，灯将被部分或悉数阻挡。灯与水的间隔也会影响作用。紫外光只能穿透5毫米深的通明盐水。

　　4、联系时刻:水暴露在紫外线下的时刻越长，杀灭才能就越强。触摸时刻，有时称为“停留时刻”，受水流速的影响:流速越慢，触摸时刻越长。灯泡的长度也会影响触摸时刻；灯泡越长，水与紫外线触摸的时刻就越长。另一个需求考虑的变量是周转时刻(水族箱中的悉数水经过消毒器所需的时刻)。由于“消毒的”水在它回来时不断地与水族箱中的水混合，不可能“消毒”水族箱中的所有水。只有当所有的水都被移走，消毒，然后一次性回来水族馆，这才有可能。